自(zì )西(🕕)元20XX年,人(rén )类从肯(📒)亚(yà )(🏽)图尔卡纳湖(🃏)的(🕋)湖畔(pàn )挖出(🛍)了(le )一(yī )(🕰)个(🤢)名叫索哈尔(🎗)(Zohar)的(🔬)物(🏴)体(🗼)之(zhī )后,便开始对它进行研(🎏)究(jiū ),后(hòu )来有人(rén )重建出(⚫)来所谓的“神之(🗄)语言”,并(bìng )建(jiàn )立电脑程式以启动原始(shǐ )(🕌)索哈尔,进行(háng )和上位领域的U-DO(上位领域当中的红色波(📎)动(dòng )(🧚)存在)连结的(🚨)连(🛑)结实验(🖲),但(dàn )很不幸地,从上位领域(yù )(🗞)流入下位领域的能(néng )量造成了事(👓)象变移,使地球(游戏中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎(hū )完从从宇(🧟)宙中(zhōng )“消失(shī )”,人类因而(ér )被迫逃(táo )亡(wáng ),离开(kāi )地球(qiú )。 到了四(➡)千年多后,在故事开始(shǐ )(🌪)前十五的(de )T.C.4753年,米(mǐ )尔(ěr )(🤔)奇(📧)亚(🔍)行星(xīng )(Miltia)爆发了所谓的米(🏃)尔奇亚冲突事(🌂)件,在此次事件(jiàn )当中,米尔奇亚行星的(🍁)人类疑似遭到了格诺西斯(sī )(Gnosis)的(📬)攻击,并在冲突事(shì )件后(🏸)消(xiāo )失,但事件的(👅)真相却因为米尔(ěr )奇亚的消失(🖱)而不为(wéi )人知。在事件(jiàn )后(🙅),启(🛌)动(dòng )(🍾)原始索哈尔(🐇)(后来人类制(zhì )造出(🐣)了(🌒)十(shí )二具索哈(hā )尔(ěr )模(🍈)拟(🕌)体,因此(cǐ )原(yuán )有的索哈(🏁)尔就被称之为原(yuán )(🤠)始(shǐ )索哈尔)所需的神(⛱)之语言(yán )(📸)、原始索哈(🎇)尔的研究成果、米尔奇亚(🚔)的U.M.N.座标(⏩)等(děng )事物,都被封存(cún )在Y资料(liào )当(🤙)中,而(⛄)Y资(🤫)料又(🎛)被(🍆)封存(💍)在百式观测用合(hé )成人(Relian)M.O.M.O.的意(yì )识内,然(♿)而这么做(🥡)却(què )引起了各方势力(🐊)对(duì )(📻)M.O.M.O.的争(☔)夺,因(🚹)此星团联(lián )邦(🏥)政(zhèng )府(fǔ )(游(yóu )戏中统(tǒng )治(🎁)各行星的政府(fǔ ),英文名Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的(🌵)生化人(Cyborg),以(yǐ )保护M.O.M.O.的(📑)安全。 另一方面,在米尔奇亚冲(💦)突事(shì )件结束后的十(📀)几(🐑)年(nián )(♈),也就是大约在游(yóu )(⏭)戏EPI开始的时候,当时最(📮)大的(📂)企业贝克达公司以对抗格诺西斯侵(qīn )扰的名义(⭕),进行对(🎑)格诺西斯用(😞)战斗兵器(🐆)KOS-MOS的开发(fā )计划,但和(hé )当时(shí )多使(shǐ )用合成(chéng )人(Relian)与(📢)生(🐂)化人(rén )(Cyborg)的情况所不同(tóng )的是,KOS-MOS是个纯粹的(de )机械制品。另一(yī )方面,在EPI开始(shǐ )时(🔋),参与KOS-MOS开(kāi )发(💺)计划(🚱)的贝(👪)克(kè )达(📃)公(🏽)司(sī )第一开发(fā )局研究(🕙)人员卯月紫苑,正乘着当时载有还没正式(shì )启(qǐ )动(dòng )的KOS-MOS的(de )(❤)Woglinde号(hào )太(🍶)空船进行旅(lǚ )途(tú )。但(♟)没想到其太空(kōng )船却被(bèi )冲著索(suǒ )哈尔(ěr )(😙)而来的(de )格诺西斯(sī )所(suǒ )攻(👼)击,而KOS-MOS也在(zài )(🥚)此(cǐ )(🔥)时突然启动,卯月紫(😐)苑因而被卷入一连串和格诺西斯及索哈尔有关的阴谋(móu )(📪),以(yǐ )及会改变人类(🐬)命运的(🕝)事(🆔)件当中(zhōng )……