自西元20XX年,人类从肯(kěn )亚图(tú )尔卡(kǎ )纳湖的湖畔挖出(chū )了一个名叫索哈尔(🎗)(Zohar)的物(wù )体(🗼)之(🐮)后,便开始对它进行研究(jiū ),后(hòu )(🏇)来有人(😎)重(chóng )建(jiàn )出(⚫)来所谓的“神(🤷)之语言”,并(bìng )建立(lì )电脑程(chéng )式以启动原始(shǐ )索(🛺)哈尔(ěr ),进(🥞)行和上位领(🙁)域的U-DO(上位领域当中(💞)的(⏺)红色波动存(cún )(🚣)在)连(lián )结(📯)的连结(jié )实验,但很不幸地,从上(🥎)位领域(🗞)流入下(xià )位(wèi )领域的能量(liàng )造(🌞)成了(le )事象变移,使(shǐ )地球(qiú )(游戏中所(suǒ )谓(🧤)的“失落耶路撒冷”)几(🤳)乎(hū )完从从宇宙中(🧣)“消(⚾)失”,人类因(🈁)而(❕)被迫(💹)逃亡,离(🍑)开地球。 到了四千年多后,在(zài )故事开(🃏)始(🌪)前十五的(💹)T.C.4753年,米尔奇亚行星(Miltia)爆发(fā )(♌)了所谓的米(🏃)尔奇亚(yà )冲突事件(jiàn ),在此(cǐ )次(cì )(🆙)事件当中(zhōng ),米尔(📞)奇(qí )亚行星(xīng )(🎐)的人类疑似遭(zāo )到了格(🚻)诺西斯(Gnosis)的(📬)攻击,并(bìng )在冲(🚤)突事件后消失(shī ),但事件的真(zhēn )相(🐈)却因为(🔍)米尔奇亚(🚪)的(de )消失而不为(😲)人(rén )知。在事件后,启动原始索哈(📯)尔(后来人类制造出了十二具索哈尔模拟体,因此原有的索(suǒ )哈尔(🍏)就被称之为(wéi )(😄)原始索哈(hā )尔)所(👧)需的神(shén )之语言、(🌲)原始索哈尔的研究成果、(🏉)米尔奇亚的U.M.N.座(zuò )(🏓)标等事(🔡)物,都被(bèi )(🏫)封存在Y资料当(dāng )中,而Y资(zī )料又(🎛)被(bèi )封存(💍)在百式(shì )观测(🆕)用合(🕠)成人(Relian)M.O.M.O.的意识内,然而这(🈲)么做(🥡)却引起了各方势力(🐊)对M.O.M.O.的争夺(duó )(📧),因此(🚄)星团联邦政府(fǔ )(游戏中统治各行(🛺)星的政(zhèng )府,英文名Galaxy Federation)雇(🏺)了一个(gè )名(míng )(🔷)叫Ziggurat 8的生化(huà )人(Cyborg),以保(bǎo )护M.O.M.O.的安全。 另一方面(miàn ),在米尔奇亚冲突事件(jiàn )结束后的十(shí )几年,也就是(shì )大(🎄)约在游戏EPI开始的时候,当时(shí )最大的企业(yè )贝克达公司以对抗格诺西斯(sī )(🈴)侵(🥑)扰(rǎo )的名(míng )义,进行对(🎑)格(📐)诺西斯用战斗(👵)兵器(🐆)KOS-MOS的开发(🥗)计划,但(dàn )和当时多(duō )使(🏟)用合成(chéng )人(📌)(Relian)与生化(huà )人(Cyborg)的情况所不同(tóng )(💴)的是,KOS-MOS是(🐻)个纯(chún )粹(🧜)的机械(xiè )制品。另一方(😣)面,在EPI开始时(shí ),参与KOS-MOS开发计划的贝克达(dá )公(🏽)司第(🗝)一开(〰)发(🙃)局研究人(😯)员卯月紫苑,正乘着当(🛹)时载有还(hái )(🈶)没正(zhèng )式启动(🚒)的(de )KOS-MOS的(de )Woglinde号太(tài )空船进(📚)行旅途。但(♟)没想(xiǎng )到(dào )其太空船却被冲著索(suǒ )哈尔而来的格(🖐)诺西斯所(suǒ )(🐥)攻(👼)击(🦖),而(🤛)KOS-MOS也在此时突(🏳)然(rán )启(✏)动,卯月(yuè )紫苑因而(ér )被卷入(rù )一连串(🍯)和格(🌳)诺(nuò )西(xī )(🤯)斯(🖇)及索(suǒ )哈尔(ěr )有(yǒu )关的阴(🎿)谋(📪),以及会改(gǎi )变(🌂)人(rén )类命运的事件当中……